大學(xué)院系：醫(yī)學(xué)系、口腔醫(yī)學(xué)系、運動醫(yī)學(xué)系、護校、研究生醫(yī)學(xué)系、國際學(xué)生預(yù)科系、大學(xué)預(yù)科教育系。大學(xué)由70個教研室、14個臨床診所、4個科研所（藥理學(xué)、心臟病學(xué)、腎臟學(xué)、肺病學(xué)）組成。

醫(yī)學(xué)系和運動學(xué)系學(xué)期為6年，口腔醫(yī)學(xué)系學(xué)期為5年。

專業(yè)科前四個學(xué)期的課程包括：

    基本原理和微生物學(xué)課程，人體解剖、生物和醫(yī)學(xué)物理、生物學(xué)、普通化學(xué)和醫(yī)學(xué)化學(xué)、生物組織學(xué)、生物化學(xué)、人體生理學(xué) ；
    在第四和第五個學(xué)期上述課程還包括：微生物學(xué)、病理分析、病理生理學(xué)、普通藥理學(xué)、普通外科、內(nèi)部疾病的預(yù)防、和其它一些課程。
在完成了基本的微生物學(xué)習(xí)后，學(xué)生開始學(xué)習(xí)臨床課程，這個期間他們有如下課程：外科、內(nèi)部疾�。▋�(nèi)科）、傳染病、產(chǎn)科學(xué)和婦科醫(yī)學(xué)、精神病學(xué)、神經(jīng)疾病、皮膚病和性病學(xué)、和其它課程�？谇豢葡档膶W(xué)生在第四個學(xué)期期間開始學(xué)習(xí)專業(yè)課程，如整形外科、口腔病外科等。
    第三年重點學(xué)習(xí)生物體的普通病理學(xué)和癥狀學(xué)。藥理學(xué)課程作為內(nèi)科和普通外科和預(yù)備教育課程。
    第四、五、六年重點是在設(shè)備齊全的醫(yī)院、產(chǎn)房、門診診所和急救站進行有組織的臨床醫(yī)學(xué)訓(xùn)練。
    巴甫洛夫國立醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院有2000多個床位和一個大型的門診部，專業(yè)是腎病學(xué)、肺病學(xué)、心臟病學(xué)。

    國際學(xué)生預(yù)科系：

    國際學(xué)生預(yù)科系于1967年開始建立，預(yù)科學(xué)期為一年。留學(xué)生主要學(xué)習(xí)俄語、生物、化學(xué)、物理，數(shù)學(xué)和信息學(xué)。對不同學(xué)生這些課程的選擇，依據(jù)本科所選專業(yè)的需要。